Jemaat–jemaat PERKI mempunyai misi yang sama dengan Jemaat PERKI-PKN, yaitu: mempersatukan, melayani dan mengayomi umat kristiani dengan latar belakang ke-Indonesiaan agar dapat berpartisipasi
dan bersosialisasi dengan kehidupan di negeri Belanda.
De missie van Jemaat-jemaat PERKI is gelijk aan die van Protestantse Gemeente PERKI Nederland: het verlenen van diensten aan, verenigen van en het bewaken van de met Indonesische achtergrond in Nederland wonende christenen zodat ze kunnen participeren en socialiseren in de
Nederlandse samenleving.
Zie verder ons beleidsplan.